黒いつぶは金属微粉または金属微粉のサビに由来するものです。ステンレスボウルは一見サビていないように見えても、表面が黒くサビている場合があります。
発生状況としては、
(1) 泡立て器とステンレスボウルの擦れによる発生
(2) 泡立て器の柄の内部のサビまたは汚れがホイップ時に落下
(3) ボウル洗浄時の研磨による金属微粉の残存（表面に付着した微粉は、流水では落ちずに残存し、見た目にはわからないがサビている場合があります）
 等が考えられますが、金属のこすれから発生したのか、汚れなどから発生したのかがわかりかねますので、メーカーとしてお召し上がりになることはお勧めしておりません。
防ぐ方法としてはガラス製やプラスチックボウルをお使いいただくことをお勧めいたします。